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生物学重复之间 imToken官网RNA-seq 结果具有可重复性

作者:imToken官网发布时间:2024-05-27 00:31

(b)为乙烯处理。

进而分析与植物激素信号转导相关的差异表达基因, Università del Salento, 图为菊花在水和乙烯处理下 79 天后的表型, F.; Jiang,而 MYB 和 bHLH 两个转录因子家族基因在乙烯利处理后既有上调表达又有下调表达,并发现它们在乙烯利处理的样本中出现差异上调表达, 研究过程与结果 本文所用到的研究材料是由南京农业大学菊花种质资源保存中心提供的“神马”菊花插条,此外作者还发现节律钟相关基因在乙烯处理后均出现上调表达,对乙烯利处理的菊花进行 RNA 提取和测序。

南京农业大学蒋甲福教授团队——菊花对乙烯反应的转录组分析

乙烯利 (乙烯生成剂) 被广泛用于控制开花时间, 试验发现乙烯会抑制菊花开花。

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初步得出结论: 乙烯信号基因可能参与菊花的开花调控; 乙烯可能主要影响生长素和 ABA 信号传导以调节花诱导; 乙烯可能会扰乱昼夜节律从而抑制开花; 成花激活因子AFL1可能是乙烯处理后影响开花的关键基因; MYB 和 bHLH 转录因子家族可能参与乙烯介导的菊花开花延迟,此外,在液氮中速冻,对照 (标记为 C) 和乙烯利处理(标记为 T) 样品分别指定为 C-1、C-2 和 C-3 以及 T-1、T-2 和 T-3,在菊花生产过程中,这表明它们可能参与乙烯介导的菊花开花调控,处理后 6 天取样,南京农业大学蒋甲福教授及其团队在Horticulturae期刊发表了文章, 428. Horticulturae 期刊介绍 主编:Luigi De Bellis,乙烯介导的菊花开花延迟的分子机制尚不清楚,imToken钱包下载,由于乙烯利处理后显著抑制菊花开花,研究者进一步分析开花相关基因的表达情况,为了验证 RNA-seq 结果的可信度,并储存在80°C, Italy 期刊重点关注温带到热带园艺的所有领域及相关学科, L.; Chen,对 6 份冷冻样本进行 RNA 提取和测序,imToken, M.; Si, H.; Zhou, S.; Chen。

每个处理设置 3 个生物学重复, 研究总结 本研究利用 RNA 测序技术 (RNA-seq) 对短日照下菊品种“神马”经乙烯利处理和清水处理的植株进行转录组分析,为进一步的研究提供了有用的数据,于 22:30 至 00:30 用黄色荧光灯照射 2 小时, 菊花是世界最重要的切花之一, 揭示了参与乙烯介导的菊花开花时间调节的候选基因, W.; Wang,包括 2 个乙烯信号基因 (CTR1和EBF2) 和 2 个开花基因 (AFL1和TFL1),分析植物激素信号传导相关差异表达基因,每个样品包含三个顶端分生组织和第三片完全展开叶 (从上往下数),乙烯可以延迟菊花开花,而位于乙烯信号路径下游的大多数乙烯反应因子 (ERFs) 表达下调,9,选择候选开花基因CmAFLI进行异源转化,。

在乙烯利处理后,鉴定了参与乙烯信号通路的部分基因:ETHYLENE RESPONSE 2(ETR2)、CONSTITUTIVE TRIPLE RESPONSE 1(CTR1) 和 EIN3-BINDING F-BOX PROTEIN 2(EBF2) ,并在温室中自然光下生长。

初步判断乙烯利处理是分离数据集的关键驱动因素,结果表明CmAFL1可以促进拟南芥开花, 2022 Impact Factor: 3.1 2022 CiteScore: 2.4 Time to First Decision: 14.7 Days Acceptance to Publication: 2.6 Days

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